Laboratórium je špecializované na základnú úpravu vzoriek (napr. laboratórne váhy, analytické váhy, sušiarne, muflova pec, digestor). V laboratóriu je možné zostaviť experimentálne aparatúry, nachádzajú sa tu viaceré zariadenia na destiláciu a extrakciu vzoriek, Kjehdahlova aparatúra pre destilačné stanovenie celkového dusíka a pod. V laboratóriu sa zároveň realizuje štúdium progresívnych oxidačných procesov (AOP) a ich kombinácií, nachádza sa tu napr. ozonizátor Sander Ozonizer S 500 s výkonom 0 – 500 mg ozónu za hodinu a vzduchovým čerpadlom, sklenené UV reaktory Photochemical reactors LTD s objemom 200 a 500 ml s 120 alebo 400 W tlakovou ortuťovou lampou či zariadenie pre sonifikáciu vzoriek